一般而言，HPV 疫苗是安全的，大多數學童在接種此疫苗後，都不會有嚴重反應。常見的副作用與其他疫苗相似，包括：
HPV 疫苗安全嗎？
HPV 疫苗已在全世界使用多年。經廣泛檢視 HPV 疫苗相關的科學研究及所引起的不良反應數據，世界衞生組織和海外衞生部門已表明 HPV 疫苗安全有效，亦無證據證明顯著副作用由接種 HPV 疫苗所引起。
不適用人士
如正服用藥物，但不清楚能否接受該疫苗注射，建議先諮詢醫生意見或於注射日攜同有關藥物給醫護人員檢查，方決定是否適合注射。
HPV 疫苗的功效對從未感染 HPV 的女性最為顯著，因此疫苗接種以未開始性行為的適齡女童為對象。研究表明，接種 HPV 疫苗不會讓孩子性活躍或提早發生性行為。
加衛苗 Gardasil (9合1) 子宮頸癌HPV疫苗可預防80-90%的HPV相關癌症與疾病。愈早接種，愈早得到保護。
三針療程: 適合15歲或以上人士接種 (男女均可), 於6個月(0、2、6個月)或4個月(0、1、4個月) 完成。
第二針須於注射第一針後至少一個月接種，第三針則於注射第二針後至少三個月接種。整個三針療程必須於注射第一針後起計一年內完成。
兩針療程：適合9至14歲 (男性或女性), 於0、5-13個月接種兩針
*若第二針在注射第一針後的五個月內接種，則須接種第三針
疫苗能夠提供長久的預防作用，一般無需接種加強劑
